Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT3P12035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT3P12035 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT3P12035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT3P12035 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT3P12035 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT3P12035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT3P12035 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT3P12035 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT3P12035 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT3P12035 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT3P12035 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT3P12035 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT3P12035 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT3P12035 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT3P12035 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT3P12035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT3P12035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT3P12035 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT3P12035 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT3P12035 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT3P12035 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT3P12035 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT3P12035 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT3P12035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms