Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD8BP10966 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD8BP10966 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8BP10966 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8BP10966 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CD8BP10966 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD8BP10966 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD8BP10966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD8BP10966 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD8BP10966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD8BP10966 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD8BP10966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8BP10966 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8BP10966 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8BP10966 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8BP10966 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD8BP10966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD8BP10966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD8BP10966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD8BP10966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8BP10966 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8BP10966 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8BP10966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8BP10966 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD8BP10966 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD8BP10966 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms