Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPP1P10451 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPP1P10451 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPP1P10451 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPP1P10451 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPP1P10451 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPP1P10451 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPP1P10451 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPP1P10451 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPP1P10451 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPP1P10451 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPP1P10451 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPP1P10451 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPP1P10451 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPP1P10451 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPP1P10451 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPP1P10451 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPP1P10451 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPP1P10451 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPP1P10451 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPP1P10451 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPP1P10451 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPP1P10451 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPP1P10451 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPP1P10451 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPP1P10451 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPP1P10451 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms