Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF728P0DKX0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF728P0DKX0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF728P0DKX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms