Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSL3P1P0C860 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3P1P0C860 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms