Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB1P08183 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB1P08183 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms