Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCGP05129 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCGP05129 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKCGP05129 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms