Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P02748 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9P02748 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9P02748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9P02748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9P02748 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C9P02748 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9P02748 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C9P02748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9P02748 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9P02748 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P02748 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P02748 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P02748 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P02748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9P02748 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9P02748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9P02748 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9P02748 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9P02748 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P02748 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P02748 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P02748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P02748 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9P02748 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9P02748 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9P02748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9P02748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9P02748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9P02748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9P02748 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9P02748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms