Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MATN4O95460 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MATN4O95460 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN4O95460 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN4O95460 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN4O95460 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN4O95460 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MATN4O95460 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN4O95460 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN4O95460 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN4O95460 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN4O95460 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MATN4O95460 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MATN4O95460 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN4O95460 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN4O95460 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN4O95460 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN4O95460 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MATN4O95460 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MATN4O95460 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MATN4O95460 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN4O95460 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN4O95460 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN4O95460 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN4O95460 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MATN4O95460 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN4O95460 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN4O95460 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN4O95460 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN4O95460 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN4O95460 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN4O95460 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN4O95460 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN4O95460 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN4O95460 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN4O95460 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN4O95460 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN4O95460 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN4O95460 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN4O95460 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms