Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CILPO75339 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CILPO75339 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CILPO75339 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CILPO75339 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CILPO75339 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CILPO75339 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CILPO75339 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CILPO75339 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CILPO75339 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CILPO75339 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CILPO75339 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CILPO75339 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CILPO75339 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CILPO75339 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CILPO75339 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CILPO75339 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CILPO75339 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CILPO75339 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CILPO75339 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CILPO75339 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CILPO75339 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CILPO75339 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CILPO75339 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CILPO75339 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CILPO75339 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CILPO75339 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms