Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA6O60684 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KPNA6O60684 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KPNA6O60684 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA6O60684 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA6O60684 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA6O60684 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA6O60684 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KPNA6O60684 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms