Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
URB1O60287 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
URB1O60287 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
URB1O60287 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
URB1O60287 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
URB1O60287 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
URB1O60287 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
URB1O60287 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
URB1O60287 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
URB1O60287 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
URB1O60287 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
URB1O60287 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
URB1O60287 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
URB1O60287 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
URB1O60287 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
URB1O60287 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
URB1O60287 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
URB1O60287 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
URB1O60287 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
URB1O60287 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
URB1O60287 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
URB1O60287 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
URB1O60287 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
URB1O60287 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
URB1O60287 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
URB1O60287 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
URB1O60287 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
URB1O60287 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
URB1O60287 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms