Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD21O60216 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD21O60216 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD21O60216 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD21O60216 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD21O60216 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD21O60216 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD21O60216 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD21O60216 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD21O60216 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD21O60216 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD21O60216 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD21O60216 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD21O60216 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD21O60216 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD21O60216 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD21O60216 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD21O60216 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD21O60216 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD21O60216 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD21O60216 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD21O60216 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD21O60216 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD21O60216 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD21O60216 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD21O60216 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD21O60216 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD21O60216 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD21O60216 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD21O60216 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD21O60216 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD21O60216 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD21O60216 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD21O60216 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms