Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP9BO43861 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9BO43861 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9BO43861 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms