Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1GO43497 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1GO43497 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1GO43497 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms