Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SART1O43290 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SART1O43290 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SART1O43290 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SART1O43290 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SART1O43290 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SART1O43290 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SART1O43290 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SART1O43290 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SART1O43290 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SART1O43290 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SART1O43290 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SART1O43290 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SART1O43290 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SART1O43290 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SART1O43290 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SART1O43290 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SART1O43290 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SART1O43290 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SART1O43290 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SART1O43290 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SART1O43290 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SART1O43290 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SART1O43290 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SART1O43290 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SART1O43290 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SART1O43290 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SART1O43290 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SART1O43290 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SART1O43290 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SART1O43290 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SART1O43290 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SART1O43290 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SART1O43290 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SART1O43290 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SART1O43290 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SART1O43290 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SART1O43290 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SART1O43290 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SART1O43290 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SART1O43290 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SART1O43290 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SART1O43290 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SART1O43290 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SART1O43290 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SART1O43290 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SART1O43290 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SART1O43290 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SART1O43290 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms