Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GSC2O15499 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSC2O15499 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSC2O15499 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSC2O15499 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSC2O15499 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GSC2O15499 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GSC2O15499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSC2O15499 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSC2O15499 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSC2O15499 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSC2O15499 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSC2O15499 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSC2O15499 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GSC2O15499 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSC2O15499 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSC2O15499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSC2O15499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSC2O15499 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSC2O15499 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSC2O15499 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSC2O15499 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSC2O15499 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSC2O15499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSC2O15499 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSC2O15499 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSC2O15499 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSC2O15499 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSC2O15499 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSC2O15499 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSC2O15499 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSC2O15499 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSC2O15499 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSC2O15499 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms