Protein–RNA interactions for Protein: O14657

TOR1B, Torsin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1BO14657 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOR1BO14657 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOR1BO14657 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms