Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA4O00629 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA4O00629 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA4O00629 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms