Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3QR06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QR06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QR06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QR06 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QR06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QR06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QR06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QR06 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QR06 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QR06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QR06 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QR06 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QR06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QR06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QR06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QR06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QR06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QR06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QR06 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
J3QR06 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QR06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QR06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QR06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QR06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QR06 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QR06 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms