Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms