Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLRC4-KLRK1H3BQV0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KLRC4-KLRK1H3BQV0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLRC4-KLRK1H3BQV0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms