Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf172C9J069 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf172C9J069 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf172C9J069 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms