Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8B2A6NJW9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8B2A6NJW9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms