Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCRBV7S3A2A0A539 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S3A2A0A539 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCRBV7S3A2A0A539 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S3A2A0A539 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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