Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0B4J2C4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0B4J2C4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0B4J2C4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms