Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASXL3Q9C0F0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASXL3Q9C0F0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms