Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCT8L2Q96SF2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCT8L2Q96SF2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms