Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNC2Q96PR1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms