Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LTV1Q96GA3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms