Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNF214Q8ND24 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF214Q8ND24 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms