Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms