Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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HIST2H2BEQ16778 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
HIST2H2BEQ16778 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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