Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms