Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZBED6P86452 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms