Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC12A2P55011 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms