Protein–RNA interactions for Protein: P46059

SLC15A1, Solute carrier family 15 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC15A1P46059 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC15A1P46059 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms