Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODC1P11926 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODC1P11926 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODC1P11926 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms