Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4E171 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4E171 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4E171 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms