Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFIP11Q9UBB9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms