Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
BPESC1Q9GZL8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
BPESC1Q9GZL8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms