Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BRIP1Q9BX63 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRIP1Q9BX63 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms