Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms