Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZBED5Q49AG3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms