Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO4Q2I0M5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSPO4Q2I0M5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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