Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCLAFQ15004 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms