Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB40BQ12829 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms