Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms