Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MYF6P23409 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYF6P23409 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYF6P23409 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms