Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RLBP1P12271 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms